104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2431 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 161 aa  338  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  338  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  98.76 
 
 		 161 aa  335  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  98.76 
 
 		 161 aa  335  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  52.86 
 
 		 161 aa  161  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  48.99 
 
 		 170 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  48.67 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  44.3 
 
 		 167 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  48.25 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  48.95 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  47.55 
 
 		 155 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  47.55 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  50.76 
 
 		 155 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  50.76 
 
 		 155 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  50.76 
 
 		 155 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  38.82 
 
 		 170 aa  123  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  43.8 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  43.8 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  43.94 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  43.94 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  43.07 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  43.18 
 
 		 153 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  36.76 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  42.59 
 
 		 332 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  37.1 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.88 
 
 		 332 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.29 
 
 		 159 aa  87.8  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.29 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  42.99 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  35.9 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  30.67 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  33.05 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  35.14 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  32.12 
 
 		 333 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.6 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.86 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  37.5 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  34.43 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  38.61 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  31.03 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.92 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  33.01 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.48 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.95 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  34.29 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  34.19 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.98 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  31.37 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  35.24 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.65 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  31.93 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.56 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.06 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.08 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.95 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  31.71 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3425  cupin 2, barrel  32.79 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4943  cupin 2 domain-containing protein  32.79 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637992  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  32.98 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5343  cupin 2 domain-containing protein  32.79 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499051  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  32.67 
 
 		 167 aa  62  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  34.38 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  29.93 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  33.01 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  28.81 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  27.78 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  29.9 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  31.91 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.87 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  31.68 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  31.68 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.72 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  30.77 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  30.51 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  29.84 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4561  cupin 2 domain-containing protein  33.03 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  27.12 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.28 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 372 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 115 aa  44.7  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.36 
 
 		 123 aa  43.9  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.78 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0118  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 125 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 115 aa  42.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  37.14 
 
 		 115 aa  42  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  34.78 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0579  hypothetical protein  35.29 
 
 		 261 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.855495 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0633  hypothetical protein  35.29 
 
 		 261 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0572  hypothetical protein  35.29 
 
 		 261 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0574  hypothetical protein  35.29 
 
 		 261 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3626  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.1 
 
 		 159 aa  41.2  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1227  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, interruption-C  32.14 
 
 		 257 aa  40.8  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.192593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>