77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3425 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5343  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 160 aa  329  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499051  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4943  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 160 aa  329  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637992  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3425  cupin 2, barrel  100 
 
 		 160 aa  329  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  93.75 
 
 		 160 aa  314  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0251  hypothetical protein  59.76 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.319828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  38.1 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  37.65 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  35.48 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  27.73 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  31.86 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  32.52 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.52 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  36.59 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  36.59 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  36.59 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  32.43 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.79 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  32.79 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  32.71 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  35.83 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  36.14 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  41.03 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  28.1 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  34.23 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  36.07 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  33.06 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  34.69 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  34.65 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.73 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  27.83 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  29.59 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.73 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  36.07 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  36.96 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.19 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  33.66 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.67 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  33.67 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.67 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  32.61 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  27.56 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  28.89 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  32.67 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  28.89 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  28.89 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  28.89 
 
 		 160 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  37.18 
 
 		 333 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  28.89 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  28.89 
 
 		 153 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  26.37 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  28.24 
 
 		 119 aa  48.5  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  28.09 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  26.55 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  31.03 
 
 		 190 aa  47.4  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.07 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  30.68 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  26.62 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  26.36 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  28.24 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  26.88 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  27.78 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.06 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  36.96 
 
 		 201 aa  42.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4561  cupin 2 domain-containing protein  33.62 
 
 		 151 aa  42  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  25.58 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.06 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 199 aa  41.2  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  38.46 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.24 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.44 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>