111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0565 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.21 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  33.09 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.07 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.1 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  34.43 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.37 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.36 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.74 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  33.02 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  32.54 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  29.61 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  36.36 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  31.67 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  32.65 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  27.92 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  31.3 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.83 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.45 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.63 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.89 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.55 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  30.85 
 
 		 338 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.51 
 
 		 204 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  34.29 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  32.67 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.51 
 
 		 204 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  31.19 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.02 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.44 
 
 		 377 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.64 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.93 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  36 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  31.71 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  27.66 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  34.67 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  37.84 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  41.27 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.68 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 		 178 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.29 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.5 
 
 		 389 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11002  dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07350)  27.27 
 
 		 355 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.627949  normal  0.657367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  31.86 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 208 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 208 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0028  double-stranded beta-helix-like protein  30.86 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 208 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  30.36 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  30.36 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  27.5 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  30.36 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.28 
 
 		 356 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  26.04 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.05 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 333 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.11 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  37.1 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 182 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  29.23 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  30.4 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  30.3 
 
 		 152 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  27.52 
 
 		 158 aa  43.9  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087666  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  34.78 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  31.4 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2709  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.87 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.16 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06772  conserved hypothetical protein  33.78 
 
 		 372 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36 
 
 		 332 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2878  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  27.88 
 
 		 497 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.4 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  36 
 
 		 159 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2209  MerR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 85 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000991087  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5448  cupin 2, barrel  31.76 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.708388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5845  cupin 2 domain-containing protein  31.76 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  26.19 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  26.19 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  27.38 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  26.19 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.58 
 
 		 421 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  24.78 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  26.19 
 
 		 186 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  29.91 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  28 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  29.91 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  29.91 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>