62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5062 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  319  9.000000000000001e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  65.13 
 
 		 163 aa  200  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.74 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  38 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  40.86 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  32.29 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  36 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  31.65 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  31.5 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.39 
 
 		 195 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.66 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.02 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.69 
 
 		 182 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.3 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.51 
 
 		 204 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.51 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.46 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  28.91 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  36.49 
 
 		 311 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  31.52 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 356 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.54 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  27.34 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.55 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  34 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  46.67 
 
 		 332 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.91 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  31.4 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.77 
 
 		 377 aa  43.9  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.14 
 
 		 389 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5084  cupin superfamily protein  28.32 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259637  normal  0.536671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  26.67 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0378  cupin region  36 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.22 
 
 		 332 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.44 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4314  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.671076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.05 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2748  hypothetical protein  35.62 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  28.23 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  27.42 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  26.17 
 
 		 189 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  32.95 
 
 		 110 aa  42.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.44 
 
 		 159 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  35.94 
 
 		 124 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.34 
 
 		 133 aa  42.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  40.82 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 333 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  34.67 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1032  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 		 121 aa  41.2  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0056  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  31.94 
 
 		 467 aa  41.2  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10784  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7057  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 333 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  27.68 
 
 		 139 aa  41.2  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 421 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 192 aa  40.8  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.47 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  40.4  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.26 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>