32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0454 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 356 aa  734    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.63 
 
 		 389 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 377 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  25.61 
 
 		 338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.33 
 
 		 192 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.82 
 
 		 159 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11002  dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07350)  23.65 
 
 		 355 aa  53.1  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.627949  normal  0.657367 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  29.27 
 
 		 174 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06772  conserved hypothetical protein  36.62 
 
 		 372 aa  50.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.61 
 
 		 149 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  29.17 
 
 		 163 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  29.17 
 
 		 163 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  28.67 
 
 		 179 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  34.38 
 
 		 157 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  24.82 
 
 		 145 aa  47  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.1 
 
 		 145 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  29.49 
 
 		 190 aa  47  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.48 
 
 		 166 aa  46.2  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  25.69 
 
 		 147 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  30.28 
 
 		 155 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  29.37 
 
 		 159 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  33.68 
 
 		 163 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.14 
 
 		 166 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 		 153 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  29.09 
 
 		 166 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  24.77 
 
 		 147 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  24.77 
 
 		 147 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  24.77 
 
 		 147 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  24.77 
 
 		 147 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  24.77 
 
 		 147 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  24.77 
 
 		 147 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.4 
 
 		 165 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>