62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3908 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 186 aa  386  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.76 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 		 182 aa  107  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.39 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.9 
 
 		 160 aa  99.4  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.89 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.92 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.95 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.66 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  29.37 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  28.77 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.47 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  36.78 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  29.29 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.13 
 
 		 159 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.18 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2831  cupin 2 domain-containing protein  34.52 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  26 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  31.4 
 
 		 137 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.68 
 
 		 163 aa  51.2  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.72 
 
 		 159 aa  51.2  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  25.56 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2044  hypothetical protein  45.45 
 
 		 128 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  31.31 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.71 
 
 		 153 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471134  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 161 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  26.21 
 
 		 149 aa  48.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.33 
 
 		 152 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.88 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  27 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.75 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 152 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.75 
 
 		 133 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.21 
 
 		 130 aa  44.7  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.31 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.47 
 
 		 159 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.36 
 
 		 172 aa  44.7  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.87 
 
 		 146 aa  44.7  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.11 
 
 		 166 aa  44.7  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  32.81 
 
 		 135 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  27.55 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  27.36 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.71 
 
 		 111 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.07 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  22.45 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.23 
 
 		 115 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11002  dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07350)  26.13 
 
 		 355 aa  42.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.627949  normal  0.657367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 134 aa  42.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 147 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  28.99 
 
 		 153 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 147 aa  42  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  26.67 
 
 		 147 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 147 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 147 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 147 aa  42  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 147 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.15 
 
 		 138 aa  41.2  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  26.67 
 
 		 338 aa  41.2  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  26.67 
 
 		 129 aa  41.2  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5448  cupin 2, barrel  26.58 
 
 		 147 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.708388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5845  cupin 2 domain-containing protein  26.58 
 
 		 147 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>