112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4521 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  264  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  77.34 
 
 		 129 aa  215  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  79.2 
 
 		 127 aa  209  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  67.48 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3674  cupin 2 domain-containing protein  58.14 
 
 		 131 aa  160  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.206207  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.13 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  35.44 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.53 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.09 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  35.96 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  29.9 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  35.82 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.96 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.98 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  32.88 
 
 		 155 aa  48.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  28.18 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  34.33 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  34.33 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  34.33 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  33.65 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  28.07 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.56 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0737  cupin 2 domain-containing protein  31.87 
 
 		 207 aa  47.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2004  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.51 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  34.33 
 
 		 178 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.69 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1874  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.51 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.935294 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  29 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  28.05 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1685  cupin 2 domain-containing protein  36.51 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  35.48 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  34.78 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2945  cupin 2 protein  30.83 
 
 		 177 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0664771  decreased coverage  0.00000748463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  30.09 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.85 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.26 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3261  XRE family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  29.11 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  27.71 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  22.22 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  27.78 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  26.8 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  33.71 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  34.38 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.93 
 
 		 332 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  27.78 
 
 		 186 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  27.78 
 
 		 186 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3695  cupin region  40.68 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  26.5 
 
 		 150 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 188 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5854  cupin 2 domain-containing protein  28.43 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  35.48 
 
 		 170 aa  43.5  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  27.78 
 
 		 186 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 197 aa  43.5  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  34.95 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  33.02 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  34.15 
 
 		 333 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5567  cupin 2 domain-containing protein  26.32 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495662 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.82 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  26.67 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.21 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  26.6 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3228  mannose-6-phosphate isomerase  30.11 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  29.47 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4829  cupin 2 domain-containing protein  27.55 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0191257  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  34.43 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  25.22 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1786  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 		 246 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.350828 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0079  DNA-binding protein  26.67 
 
 		 191 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1767  cupin 2, barrel  37.29 
 
 		 127 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0773162  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1729  transcriptional regulator, XRE family  30.85 
 
 		 195 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.29 
 
 		 131 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1177  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.25 
 
 		 152 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  27.85 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 204 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3869  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.23 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.98 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2209  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000991087  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  33.73 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  34.38 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.88 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3966  cupin 2 domain-containing protein  29.03 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 201 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.11 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36928  predicted protein  27.5 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.67 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.67 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  32.1 
 
 		 225 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>