69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1493 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  100 
 
 		 155 aa  310  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6600  cupin 2 domain-containing protein  77.61 
 
 		 138 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  69.12 
 
 		 138 aa  191  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.35 
 
 		 127 aa  158  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.66 
 
 		 131 aa  147  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3461  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.42 
 
 		 130 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.54 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3294  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.7 
 
 		 137 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53927  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  45.22 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0396  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.86 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.337758  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.61 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2215  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4554  cupin 2 domain-containing protein  42.61 
 
 		 137 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5014  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.87 
 
 		 137 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  43.81 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3615  cupin 2 domain-containing protein  39.67 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0243585  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  42.86 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3228  mannose-6-phosphate isomerase  40.95 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3966  cupin 2 domain-containing protein  40.95 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  34.17 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3657  cupin 2, barrel  34.45 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0153  cupin 2 domain-containing protein  35.66 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621652  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4209  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.74 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.78 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  34.74 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1354  cupin 2, barrel  31.4 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.688932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3018  cupin 2 domain-containing protein  32.58 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.609339  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2202  hypothetical protein  27.94 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3156  cupin 2 domain-containing protein  34.83 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3173  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.15 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0792  hypothetical protein  34.15 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3115  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.11 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3473  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.017049  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0560  cupin 2 domain-containing protein  34.15 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172519  hitchhiker  0.000823195 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  32.63 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.63 
 
 		 180 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.83 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.693609  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3463  cupin 2, barrel  25.76 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.34 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0220  hypothetical protein  32.58 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5003  cupin 2 domain-containing protein  30.28 
 
 		 168 aa  51.2  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4895  cupin 2 domain-containing protein  30.53 
 
 		 167 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.664893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 		 122 aa  48.9  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  41.46 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  34.31 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.93 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  34.21 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  43.86 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  34.21 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  32.89 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  32.89 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.93 
 
 		 149 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  34.95 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.68 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2761  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.13 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.668807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5642  cupin 2 domain-containing protein  32.65 
 
 		 156 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 118 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.73 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.71 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3674  cupin 2 domain-containing protein  29.89 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.206207  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2140  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.66 
 
 		 288 aa  41.2  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.21 
 
 		 192 aa  41.2  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  31.25 
 
 		 171 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.82 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3711  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.13 
 
 		 138 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>