102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1714 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 150 aa  300  6.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  52.59 
 
 		 141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.44 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  35.56 
 
 		 179 aa  67  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  35.29 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.42 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.65 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.36 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  34.26 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  27.19 
 
 		 165 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  28.93 
 
 		 166 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  35.43 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  34.21 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.03 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.5 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  41.86 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  30.94 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.67 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.96 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.83 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  28.16 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  34.69 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  26.32 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.71 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  28.32 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  33.33 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.21 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.61 
 
 		 192 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  33.93 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.28 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  31.15 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  31.4 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.13 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  29.17 
 
 		 138 aa  48.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.41 
 
 		 181 aa  48.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  28.57 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  29.69 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  23.48 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.77 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.89 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.89 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1424  cupin 2 domain-containing protein  29.09 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.000000123197 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  28.38 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5028  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 		 210 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.87 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.35 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4632  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.08 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0666075 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1094  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  38.03 
 
 		 276 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000146314  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3571  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  38.03 
 
 		 276 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000174355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1147  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  38.03 
 
 		 280 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0420293  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.7 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5448  cupin 2, barrel  29.55 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.708388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5845  cupin 2 domain-containing protein  29.55 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  32.05 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.21 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.91 
 
 		 195 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  29.03 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2209  MerR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000991087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  29.03 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  32.5 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  34.29 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  31.53 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  29.03 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  29.03 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  29.03 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.69 
 
 		 421 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  34.43 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  32.79 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.51 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  28.32 
 
 		 161 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  34.44 
 
 		 174 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.53 
 
 		 191 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.12 
 
 		 113 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.31 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.94 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.69 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  28.42 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  30.95 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1685  cupin 2 domain-containing protein  36.51 
 
 		 141 aa  40.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  26.98 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087666  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1350  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 287 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.832765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  27.97 
 
 		 163 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  23.36 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0587  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.62 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.90971 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 188 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>