65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0262 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 121 aa  245  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.81 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.45 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2044  hypothetical protein  36.56 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  39.6 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.9 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.44 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0445  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.205887 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  36.47 
 
 		 147 aa  52  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.99 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.84 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2831  cupin 2 domain-containing protein  36.62 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4272  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.71 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  43.64 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  35.53 
 
 		 311 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.23 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  27.5 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 121 aa  47.4  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1457  hypothetical protein  36 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5845  cupin 2 domain-containing protein  34.67 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5448  cupin 2, barrel  34.67 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.708388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  31.11 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  32.14 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  35.82 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  35.82 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.51 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  35.82 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  35.82 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  35.82 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  35.82 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  35.82 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3322  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.98 
 
 		 255 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.93 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.92 
 
 		 350 aa  43.5  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  32.1 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.72 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.94 
 
 		 110 aa  42.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  33.8 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.94 
 
 		 110 aa  42.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  37.84 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  32.35 
 
 		 345 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.67 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6850  cupin 2 domain-containing protein  28.95 
 
 		 105 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.95 
 
 		 112 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  34.38 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  35.38 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  32.31 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3109  cupin region  29.63 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  37.31 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  28 
 
 		 370 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  34.25 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  36.54 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.14 
 
 		 294 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  39.53 
 
 		 111 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4454  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 203 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  normal  0.472987 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0737  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 207 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>