62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0006 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  219  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.81 
 
 		 111 aa  135  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  54.63 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  62.14 
 
 		 105 aa  133  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.93 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  61.7 
 
 		 111 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  64.21 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  57.69 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  50.45 
 
 		 111 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.8 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  55.05 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.8 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  55.24 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  53.77 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  51.43 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  48.15 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  59 
 
 		 111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.29 
 
 		 110 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  47.22 
 
 		 111 aa  117  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.32 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  53.33 
 
 		 109 aa  110  5e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  47.66 
 
 		 111 aa  110  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.55 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  49.52 
 
 		 117 aa  100  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.6 
 
 		 113 aa  97.4  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.66 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.88 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.81 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.81 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  45.83 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.32 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  45.74 
 
 		 115 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.79 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  49.4 
 
 		 87 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.3 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  37.76 
 
 		 219 aa  83.6  8e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  38.38 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  40.43 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.11 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  36.36 
 
 		 219 aa  60.8  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.98 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  30 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3899  cyclic nucleotide-binding protein  32.65 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  29.07 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  31.03 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.71 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.8 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  27.91 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  25.24 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.1 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  35.09 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1457  hypothetical protein  34.78 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0857  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.51 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155905 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  30.88 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  31.43 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  25.33 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.85 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  32.31 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1207  cupin 2 domain-containing protein  32.94 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  31.75 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>