24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3322 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3322  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 255 aa  531  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5176  hypothetical protein  37.05 
 
 		 253 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3738  cupin 2 domain-containing protein  28.23 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4272  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.57 
 
 		 149 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0079  hypothetical protein  23.81 
 
 		 282 aa  48.9  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5757  hypothetical protein  26.07 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  34.15 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3472  hypothetical protein  24.54 
 
 		 276 aa  45.8  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.489268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5334  hypothetical protein  24.19 
 
 		 276 aa  45.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2487  hypothetical protein  25.82 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0929015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.98 
 
 		 121 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3214  hypothetical protein  22.07 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.57 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3530  hypothetical protein  25.58 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2243  hypothetical protein  25.58 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1921  hypothetical protein  22.86 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7819  hypothetical protein  23.94 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  41.94 
 
 		 141 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0346  hypothetical protein  24.72 
 
 		 272 aa  42.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.134093  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2396  hypothetical protein  26.23 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737785 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0362  hypothetical protein  24.72 
 
 		 272 aa  42.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1001  transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 		 307 aa  42  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.04 
 
 		 165 aa  42  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3664  hypothetical protein  23.37 
 
 		 235 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>