23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3738 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3738  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 281 aa  578  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4272  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.57 
 
 		 149 aa  126  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3322  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.23 
 
 		 255 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5176  hypothetical protein  21.33 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  29.06 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3842  transcriptional activator RhaS  33.33 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4834  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 182 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197047  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3754  transcriptional activator RhaS  33.33 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0740  transcriptional activator RhaS  33.33 
 
 		 273 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0791489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 183 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3869  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 183 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 182 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 192 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  29.07 
 
 		 104 aa  43.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 183 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 184 aa  42.7  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  31.21 
 
 		 201 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 175 aa  42.4  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3472  hypothetical protein  34.48 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.489268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  37.04 
 
 		 311 aa  42.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6135  hypothetical protein  27.18 
 
 		 155 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.715074  normal  0.381762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>