13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4272 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4272  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 149 aa  308  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3738  cupin 2 domain-containing protein  41.22 
 
 		 281 aa  111  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3322  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.57 
 
 		 255 aa  90.9  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  36.84 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.71 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5176  hypothetical protein  28.41 
 
 		 253 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  34.85 
 
 		 311 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  32.18 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6135  hypothetical protein  43.75 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.715074  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  36 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  30.23 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  29.07 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  33.73 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>