17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6850 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6850  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 105 aa  219  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3954  cupin 2 domain-containing protein  63.37 
 
 		 105 aa  133  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.266948 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  38.64 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  26.53 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  35.23 
 
 		 102 aa  50.1  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  28.87 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  28.87 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  28.87 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  31.52 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0913  cupin 2, barrel  33.78 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  23.33 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1482  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.65 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.95 
 
 		 121 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.72 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 110 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  32.1 
 
 		 122 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>