51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1482 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1482  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
94 aa  192  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2655  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  50.54 
 
 
114 aa  104  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104374  hitchhiker  0.00638268 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  56.45 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  39.73 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  39.73 
 
 
169 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 
114 aa  61.6  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  39.73 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  39.73 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  42.37 
 
 
106 aa  57.8  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  42.03 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  38.36 
 
 
100 aa  54.7  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  40.32 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  33.77 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  40.91 
 
 
111 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  47.37 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  38.1 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  55 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  38.98 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.28 
 
 
113 aa  50.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0483  cupin 2 domain-containing protein  35.59 
 
 
111 aa  50.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  47.37 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  47.37 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.08 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  49.06 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 
109 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3290  cupin 2 domain-containing protein  42.59 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  40.62 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.9 
 
 
121 aa  47  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.92 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
113 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3954  cupin 2 domain-containing protein  34.67 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.266948 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2840  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.62 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.862394  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5303  hypothetical protein  31.25 
 
 
416 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.88 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  32.81 
 
 
116 aa  42.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.23 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  30.16 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6850  cupin 2 domain-containing protein  31.65 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.63 
 
 
121 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.92 
 
 
132 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  44 
 
 
122 aa  41.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4208  Methionine--tRNA ligase  38.98 
 
 
645 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0857223  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  38.1 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.92 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3664  hypothetical protein  35.82 
 
 
235 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>