91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2699 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 113 aa  236  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2840  Cupin 2 conserved barrel domain protein  67.62 
 
 		 118 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.862394  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.38 
 
 		 109 aa  149  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  53.7 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.38 
 
 		 120 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2189  cupin 2 domain-containing protein  51.43 
 
 		 116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.525757  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  50.94 
 
 		 109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  47.22 
 
 		 114 aa  123  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.219448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  50.94 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.64 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  51.04 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1805  cupin 2 domain-containing protein  47.75 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241802  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1696  cupin domain-containing protein  47.75 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.06 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2641  pectin degradation protein  48.18 
 
 		 116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.229328 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6741  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.17 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  51.65 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  47.62 
 
 		 107 aa  107  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4742  cupin 2 domain-containing protein  45.28 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000930389 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.6 
 
 		 110 aa  104  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258222  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.6 
 
 		 110 aa  103  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246266  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3105  cupin 2 domain-containing protein  42.71 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.66 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.072688  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.73 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  43 
 
 		 111 aa  94.4  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0483  cupin 2 domain-containing protein  46 
 
 		 111 aa  90.1  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  41 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.51 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  40.66 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  39.39 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  40.66 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.96 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.98 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  36.26 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  33.02 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.02 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  31.96 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  32.69 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  31.31 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  31.31 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  31.31 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  31.31 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2655  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  35.8 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104374  hitchhiker  0.00638268 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0833  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  29.9 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.94 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  30.93 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  26.73 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2188  cupin 2 domain-containing protein  29.67 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000987781  hitchhiker  0.00000388875 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.07 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.55 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4192  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.71 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  34.04 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.53 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.74 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  29.17 
 
 		 109 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.8 
 
 		 112 aa  48.9  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3290  cupin 2 domain-containing protein  26.09 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.04 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1482  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.92 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1795  cupin 2 domain-containing protein  38.16 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00267571  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  26.58 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  44.44 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  44.44 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  40.62 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.46 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  29.25 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1740  cupin 2 domain-containing protein  38.16 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0506  hypothetical protein  27.1 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0871689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.91 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  38.6 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3664  hypothetical protein  39.44 
 
 		 235 aa  42.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  24.76 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  39.71 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.05 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  31.08 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.75 
 
 		 398 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.87 
 
 		 121 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  40.32 
 
 		 167 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3856  cupin 2, barrel  24.51 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.875667 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  36.23 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.74 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.11 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2195  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.86 
 
 		 189 aa  40.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  decreased coverage  0.00112961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2463  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.92 
 
 		 165 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0556151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>