27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2188 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2188  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 101 aa  204  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000987781  hitchhiker  0.00000388875 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  34.34 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  31.31 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2840  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.98 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.862394  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  34.07 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.67 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.35 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.21 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3105  cupin 2 domain-containing protein  31.18 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  36.9 
 
 		 130 aa  50.8  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  32.53 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.17 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.219448 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  27.78 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  25.77 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.6 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2189  cupin 2 domain-containing protein  26.37 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.525757  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  29.59 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0483  cupin 2 domain-containing protein  27.54 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.8 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1805  cupin 2 domain-containing protein  26.32 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241802  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2641  pectin degradation protein  26.32 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.229328 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1696  cupin domain-containing protein  26.32 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  30.38 
 
 		 111 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>