97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2934 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 111 aa  224  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.82 
 
 		 110 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  60.55 
 
 		 110 aa  137  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  67.33 
 
 		 105 aa  136  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  59.8 
 
 		 109 aa  135  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64 
 
 		 110 aa  130  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64 
 
 		 110 aa  130  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  60.38 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  57.8 
 
 		 137 aa  127  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  57.14 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  60.2 
 
 		 111 aa  121  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  49.53 
 
 		 107 aa  120  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  59 
 
 		 109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.96 
 
 		 111 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  50.98 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  49.02 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  48.51 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 111 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.06 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  47 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  49.54 
 
 		 117 aa  104  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.02 
 
 		 116 aa  103  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.06 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.93 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.48 
 
 		 113 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  49.02 
 
 		 111 aa  102  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.76 
 
 		 113 aa  100  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  53.93 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.47 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  43.12 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  51.81 
 
 		 87 aa  93.6  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  40.78 
 
 		 214 aa  92  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  41.75 
 
 		 219 aa  90.5  8e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.45 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.36 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.26 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.26 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.11 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  39.39 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  37.93 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  32.32 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  37.93 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  27.1 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.69 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.33 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3899  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  31.94 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19880  hypothetical protein  29.79 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0406618  hitchhiker  0.00288351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  34.72 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  32.84 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  35.21 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.62 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0564  hypothetical protein  23.08 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  27.59 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0932  cupin 2 domain-containing protein  27.16 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.95 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2885  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 299 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  40.38 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0275  hypothetical protein  29.81 
 
 		 159 aa  42.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  31.43 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5186  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.41986  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1054  cupin family protein  26.44 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  36.54 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0517  cupin 2 domain-containing protein  29.63 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622754 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1690  hypothetical protein  30 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0136157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.62 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 135 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.88 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.86 
 
 		 111 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  28.99 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  29.31 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.51 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  32.31 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  31.94 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  32.86 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  22.47 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  32.86 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  32.86 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.54 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  27.87 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  36.76 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  28.77 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0891  cupin 2, barrel  25.93 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  30.77 
 
 		 306 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  38.71 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.94 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3665  hypothetical protein  25.58 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0265322 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  27.66 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5056  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 133 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2188  cupin 2 domain-containing protein  30.38 
 
 		 101 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000987781  hitchhiker  0.00000388875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>