68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2229 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  100 
 
 
115 aa  229  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  91.89 
 
 
112 aa  207  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  90.99 
 
 
112 aa  206  8e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  83.19 
 
 
124 aa  192  9e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.62 
 
 
113 aa  136  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.75 
 
 
113 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  51 
 
 
114 aa  99.4  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  53.93 
 
 
111 aa  99.8  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  49.46 
 
 
105 aa  98.2  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  50.56 
 
 
109 aa  96.3  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.65 
 
 
111 aa  94.7  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  45.37 
 
 
117 aa  94  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  46.46 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  45.74 
 
 
109 aa  89.4  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.3 
 
 
121 aa  89  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.44 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  46.24 
 
 
137 aa  87.8  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  46.24 
 
 
110 aa  87.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  43.01 
 
 
111 aa  87  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.2 
 
 
110 aa  86.7  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.2 
 
 
110 aa  86.7  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  39.18 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  37.63 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  39.6 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  40.43 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  36.08 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  37.23 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 
116 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  36.63 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.86 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.63 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  43.37 
 
 
87 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  32.74 
 
 
219 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.86 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.34 
 
 
115 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.98 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.35 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  28.97 
 
 
214 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.21 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 
112 aa  60.5  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  33.64 
 
 
219 aa  59.3  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.93 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  35.63 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  39.13 
 
 
113 aa  55.5  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  30.85 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.94 
 
 
118 aa  52  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 
120 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  34.25 
 
 
111 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  26.97 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3899  cyclic nucleotide-binding protein  25.81 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1690  hypothetical protein  27.06 
 
 
118 aa  44.3  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0136157 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0439  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.75 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395009  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  30.88 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.89 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  22.94 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0425  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0839073  hitchhiker  0.0000787974 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  30.49 
 
 
111 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  31.51 
 
 
111 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2831  cupin 2 domain-containing protein  27.14 
 
 
117 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0365  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
261 aa  41.2  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0791032  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1417  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
261 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17982  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  22.22 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7093  hypothetical protein  27.63 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1526  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
261 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.51 
 
 
166 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>