56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0699 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  250  4.0000000000000004e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  74.78 
 
 
126 aa  184  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  70 
 
 
121 aa  183  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  76.64 
 
 
111 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  61.68 
 
 
111 aa  152  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  56.36 
 
 
111 aa  136  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  60 
 
 
114 aa  130  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  56.73 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  59.05 
 
 
111 aa  127  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  54.81 
 
 
107 aa  126  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.34 
 
 
111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  52.34 
 
 
110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  53.85 
 
 
105 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  48.15 
 
 
109 aa  121  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  50.96 
 
 
110 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.4 
 
 
110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.4 
 
 
110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  52.53 
 
 
109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  50 
 
 
111 aa  117  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.63 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.28 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  48.51 
 
 
111 aa  108  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45 
 
 
116 aa  107  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.51 
 
 
111 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  42 
 
 
117 aa  96.3  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 
113 aa  90.1  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.21 
 
 
113 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42 
 
 
115 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  39.8 
 
 
214 aa  88.6  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.56 
 
 
112 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.56 
 
 
112 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  37.63 
 
 
115 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.94 
 
 
113 aa  86.3  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  39.8 
 
 
219 aa  85.9  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.71 
 
 
113 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  33.68 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  43.21 
 
 
87 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  36.73 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.05 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  35.35 
 
 
219 aa  67  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.17 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  31.82 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  30.61 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  26.13 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  30.61 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.29 
 
 
106 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  28.24 
 
 
120 aa  50.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  27.03 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  30.56 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.24 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3899  cyclic nucleotide-binding protein  27.27 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  27.03 
 
 
111 aa  42.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.17 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  29.09 
 
 
212 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 
112 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>