56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0495 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  100 
 
 
214 aa  427  1e-119  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  74.3 
 
 
219 aa  325  4.0000000000000003e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.27 
 
 
115 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  38.24 
 
 
111 aa  92.4  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.89 
 
 
113 aa  92  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  40.78 
 
 
111 aa  92  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  38.38 
 
 
111 aa  91.3  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  37.25 
 
 
126 aa  90.1  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  39.8 
 
 
121 aa  88.6  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  39.6 
 
 
109 aa  87.4  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.64 
 
 
121 aa  87.8  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  40.82 
 
 
111 aa  87.8  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 
113 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  48.19 
 
 
87 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.64 
 
 
111 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.27 
 
 
112 aa  86.7  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  39.8 
 
 
110 aa  86.3  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 
110 aa  85.9  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  41.12 
 
 
112 aa  85.9  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  37.89 
 
 
114 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.82 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.78 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  40.45 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.84 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  38.14 
 
 
105 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  35.64 
 
 
107 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  38.38 
 
 
109 aa  79  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  38.95 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  34.02 
 
 
110 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  35.35 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.99 
 
 
110 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.99 
 
 
110 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  34.69 
 
 
117 aa  71.6  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  25.59 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.98 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.93 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  29.52 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.91 
 
 
112 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.97 
 
 
112 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  28.97 
 
 
115 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.08 
 
 
112 aa  62.8  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.18 
 
 
106 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  26.14 
 
 
113 aa  48.9  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  27.37 
 
 
120 aa  48.5  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  24.27 
 
 
106 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3899  cyclic nucleotide-binding protein  27.36 
 
 
113 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3469  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 
197 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  22.55 
 
 
124 aa  45.1  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.87 
 
 
112 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1035  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 
179 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.52 
 
 
389 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2246  XRE family transcriptional regulator  38 
 
 
197 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  22.33 
 
 
106 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 
200 aa  41.6  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.77 
 
 
181 aa  41.6  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>