65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0224 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  223  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  75.45 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  72.82 
 
 		 105 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  69.09 
 
 		 110 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  65.45 
 
 		 110 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  69.31 
 
 		 110 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  69.31 
 
 		 110 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  60.75 
 
 		 114 aa  136  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.43 
 
 		 111 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  55.66 
 
 		 107 aa  130  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  57.55 
 
 		 111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  60.42 
 
 		 111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.92 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  54.21 
 
 		 111 aa  123  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  55.24 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  57.14 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  51.96 
 
 		 111 aa  121  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  56 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  50.96 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.02 
 
 		 121 aa  115  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  50 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  54.74 
 
 		 109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  46.23 
 
 		 111 aa  110  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51 
 
 		 111 aa  103  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.43 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.48 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.39 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.39 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.31 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.92 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  51.81 
 
 		 87 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  46.24 
 
 		 115 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  40.37 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.9 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  43.68 
 
 		 112 aa  84  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.95 
 
 		 113 aa  84  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  34.02 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  37.08 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  40.7 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.56 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  33.71 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  33.33 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.35 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.71 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  25.71 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  32.05 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  34.52 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  31.33 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3899  cyclic nucleotide-binding protein  29.59 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  31.03 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5186  hypothetical protein  34.62 
 
 		 312 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.41986  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  33.93 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0275  hypothetical protein  35.53 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  30.51 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.73 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1457  hypothetical protein  30.43 
 
 		 106 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  31.88 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  31.15 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  37.5 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  32.86 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  31.88 
 
 		 122 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>