58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1633 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 121 aa  254  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  77.39 
 
 		 126 aa  191  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  80.73 
 
 		 111 aa  191  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  70 
 
 		 121 aa  183  6e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  62.39 
 
 		 111 aa  152  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  59.43 
 
 		 111 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  56.86 
 
 		 114 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  53.27 
 
 		 111 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  50.93 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.4 
 
 		 111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  52.94 
 
 		 137 aa  123  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  48.6 
 
 		 110 aa  123  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.15 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  51.46 
 
 		 105 aa  121  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  51.46 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  54 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  52.58 
 
 		 111 aa  117  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  49.02 
 
 		 110 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.66 
 
 		 110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.66 
 
 		 110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.5 
 
 		 111 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.08 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.43 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46 
 
 		 115 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  36.84 
 
 		 117 aa  94.4  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 113 aa  93.6  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.21 
 
 		 113 aa  93.6  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.3 
 
 		 112 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.3 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  38.3 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  35.64 
 
 		 214 aa  87.8  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  36.63 
 
 		 219 aa  85.9  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  48.15 
 
 		 87 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.65 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  38 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.14 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.87 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  37.37 
 
 		 219 aa  70.5  0.000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  33.72 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  29.17 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  29.21 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3899  cyclic nucleotide-binding protein  32.32 
 
 		 113 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  30.56 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  26.03 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  27.59 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.56 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  25.77 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1317  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.93 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  29.09 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1033  hypothetical protein  30 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3151  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.96 
 
 		 503 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2400  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.88 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>