62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0346 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 110 aa  224  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  70.91 
 
 		 110 aa  167  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  70.91 
 
 		 110 aa  167  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  70.87 
 
 		 105 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0224  hypothetical protein  65.45 
 
 		 110 aa  155  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0691  hypothetical protein  65.38 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  63.37 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.91 
 
 		 110 aa  140  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1205  cupin 2 domain-containing protein  58.88 
 
 		 111 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.710336  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  60.55 
 
 		 111 aa  137  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.41 
 
 		 111 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  60.2 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  60.2 
 
 		 111 aa  130  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0699  hypothetical protein  52.34 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  58.76 
 
 		 109 aa  124  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1633  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.6 
 
 		 121 aa  123  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  55.05 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2188  cupin 2, barrel  51.4 
 
 		 126 aa  120  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00753726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.6 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0788  cupin 2 domain-containing protein  55.56 
 
 		 111 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.490865  normal  0.22734 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  44.86 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  49.53 
 
 		 111 aa  114  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  52.43 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.62 
 
 		 111 aa  99.8  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.58 
 
 		 115 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.55 
 
 		 113 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.09 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1645  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.09 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125951  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2016  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.16 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46 
 
 		 113 aa  94.4  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  46.46 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.31 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  45 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  53.09 
 
 		 87 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0495  5'-nucleotidase SurE  39.8 
 
 		 214 aa  86.3  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.75 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  35.05 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09790  cupin domain-containing protein  37.62 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778128 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  37.76 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.63 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  36.47 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  31.46 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3606  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.637892  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0816  cupin 2 domain-containing protein  35.23 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  36.36 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  29.89 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0259  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.53 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3899  cyclic nucleotide-binding protein  30.21 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  24.72 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  37.68 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5186  hypothetical protein  34.62 
 
 		 312 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.41986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0275  hypothetical protein  35.53 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  26.97 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.22 
 
 		 166 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1207  cupin 2 domain-containing protein  27.06 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1054  cupin family protein  27.27 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3718  cupin 2, barrel  29.17 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1317  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.83 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>