51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3670 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 111 aa  222  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1707  cupin 2 protein  52.53 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0932  cupin 2 domain-containing protein  43.93 
 
 		 109 aa  97.8  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3718  cupin 2, barrel  45 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0891  cupin 2, barrel  42.99 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  44.95 
 
 		 111 aa  90.5  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  41.12 
 
 		 111 aa  90.1  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.19 
 
 		 111 aa  83.6  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1257  hypothetical protein  38.74 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1894  hypothetical protein  39.64 
 
 		 170 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4087  cupin region  40.37 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.06 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  41.12 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  36.45 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  39.25 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  32.43 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5520  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.76 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0517  cupin 2 domain-containing protein  28.16 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  39.13 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0275  hypothetical protein  31.76 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0956  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5186  hypothetical protein  31.76 
 
 		 312 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.41986  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  32.84 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  37.88 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5845  cupin 2 domain-containing protein  36.67 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5448  cupin 2, barrel  36.67 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.708388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2156  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.47 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.888659  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  25.53 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  26.58 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0346  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144683  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  30.16 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0914  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.27 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2303  hypothetical protein  31.65 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000111298  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0903  cupin 2 domain-containing protein  32.05 
 
 		 120 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  32.84 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4464  hypothetical protein  26.03 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.289579  normal  0.0112764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  28.85 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  41.2  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  34.43 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1033  hypothetical protein  22.78 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.15 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.15 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0363  hypothetical protein  24.68 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.540367  normal  0.422558 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1054  cupin family protein  28.79 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>