24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4087 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4087  cupin region  100 
 
 		 113 aa  225  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  59.46 
 
 		 111 aa  134  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0932  cupin 2 domain-containing protein  47.66 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1707  cupin 2 protein  44.86 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3718  cupin 2, barrel  47.66 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0891  cupin 2, barrel  45.79 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  47.22 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  42.99 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  42.99 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  46.3 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.37 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.91 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5520  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.99 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  40.37 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1257  hypothetical protein  36.11 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1894  hypothetical protein  35.51 
 
 		 170 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  33.64 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0517  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622754 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1814  hypothetical protein  35.9 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5186  hypothetical protein  32.47 
 
 		 312 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.41986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0275  hypothetical protein  32.47 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.58 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3944  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.84 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0892017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  26.15 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>