53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0681 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  221  2e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1033  hypothetical protein  55.14 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0991  hypothetical protein  49.07 
 
 		 117 aa  98.6  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.166279  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1252  hypothetical protein  51.79 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00699027  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0782  hypothetical protein  60 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000506344  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1039  hypothetical protein  51 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.67228  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0852  hypothetical protein  58.82 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  36.99 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  40.3 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.81 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  37.84 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  34.78 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  36.05 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.76 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  28 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  26.51 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3718  cupin 2, barrel  32.56 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  29.76 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  30 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  39.29 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  27.06 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0754  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  31.43 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  31.08 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2655  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  35.94 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104374  hitchhiker  0.00638268 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1894  hypothetical protein  29.41 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  30.93 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2156  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.58 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.888659  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.67 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  27.69 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  26.58 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  32.35 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  29.58 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1707  cupin 2 protein  32.26 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.76 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1482  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.16 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  30.77 
 
 		 138 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  30.77 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  30.77 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  28.36 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  29.7 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  35.06 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  28.38 
 
 		 277 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  31.67 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.93 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.93 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  30.77 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0932  cupin 2 domain-containing protein  26.39 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  22.89 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0891  cupin 2, barrel  26.39 
 
 		 109 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  30.99 
 
 		 110 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>