19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0991 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0991  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  237  4e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.166279  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  49.07 
 
 
110 aa  98.6  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0782  hypothetical protein  54.44 
 
 
113 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000506344  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1252  hypothetical protein  53.33 
 
 
113 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00699027  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0852  hypothetical protein  52.22 
 
 
113 aa  90.1  9e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1039  hypothetical protein  47.73 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.67228  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1033  hypothetical protein  46.88 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  40.68 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  30.14 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  33.33 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  31.88 
 
 
115 aa  43.5  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  28.42 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  28.89 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08250  cupin domain-containing protein  25 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0145374  normal  0.40746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  31.03 
 
 
110 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.34 
 
 
111 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.38 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  31.43 
 
 
110 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>