22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7093 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7093  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  183  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0210  hypothetical protein  88.76 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4882  hypothetical protein  57.95 
 
 		 88 aa  110  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.916909  normal  0.993747 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4222  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.23 
 
 		 87 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4110  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.23 
 
 		 87 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222501  normal  0.273262 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1540  hypothetical protein  51.14 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0502839 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1346  hypothetical protein  41.57 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1281  hypothetical protein  40.96 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240636 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0864  hypothetical protein  37.5 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0387292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0531  hypothetical protein  33.73 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.64 
 
 		 112 aa  42.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0812  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.21 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000379382  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0873  cupin 2 domain-containing protein  33.93 
 
 		 108 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.61 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.64 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364082  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  27.63 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0411  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.64 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1794  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  38.78 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1718  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.69 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2828  cupin 2 domain-containing protein  29.69 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>