11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1540 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1540  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  180  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0502839 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4882  hypothetical protein  54.55 
 
 		 88 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.916909  normal  0.993747 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7093  hypothetical protein  51.14 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0210  hypothetical protein  47.73 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4110  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.73 
 
 		 87 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222501  normal  0.273262 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4222  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.73 
 
 		 87 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1346  hypothetical protein  44.32 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1281  hypothetical protein  39.24 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240636 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0531  hypothetical protein  36.36 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0864  hypothetical protein  32.43 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0387292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0873  cupin 2 domain-containing protein  29.76 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>