15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0873 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0873  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 108 aa  225  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5823  hypothetical protein  42.71 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410893  normal  0.322015 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0812  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.86 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000379382  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4110  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.62 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222501  normal  0.273262 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4222  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.62 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4882  hypothetical protein  31.71 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.916909  normal  0.993747 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0698  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 247 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2423  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 247 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0768  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 242 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1221  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 247 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563936  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1146  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 247 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112687  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1732  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 247 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1575  DNA-binding protein  34.33 
 
 		 249 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1565  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7093  hypothetical protein  33.93 
 
 		 89 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1540  hypothetical protein  29.76 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0502839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>