More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1575 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1575  DNA-binding protein  100 
 
 
249 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1565  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1146  DNA-binding protein  86.75 
 
 
247 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112687  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0698  DNA-binding protein  86.75 
 
 
247 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2423  DNA-binding protein  86.75 
 
 
247 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1732  DNA-binding protein  86.75 
 
 
247 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1221  DNA-binding protein  86.75 
 
 
247 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563936  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0768  DNA-binding protein  86.48 
 
 
242 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377611  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  77.6 
 
 
281 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  67.08 
 
 
286 aa  300  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  72 
 
 
269 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  70.33 
 
 
259 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3049  XRE family transcriptional regulator  70.33 
 
 
259 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0258201 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  70.33 
 
 
259 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2941  XRE family transcriptional regulator  71.28 
 
 
271 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0631546  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  56.18 
 
 
187 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  55.62 
 
 
187 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  53.37 
 
 
188 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 
205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  38.55 
 
 
191 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  35.2 
 
 
189 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  36.87 
 
 
190 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  36.31 
 
 
191 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  36.72 
 
 
191 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  36.72 
 
 
191 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  36.31 
 
 
190 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  36.72 
 
 
191 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  36.72 
 
 
191 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  36.31 
 
 
179 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  36.31 
 
 
179 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  36.31 
 
 
179 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  36.31 
 
 
179 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  36.31 
 
 
179 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  36.31 
 
 
179 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  36.16 
 
 
236 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 
192 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 
192 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 
192 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  36.16 
 
 
236 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 
192 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  35.03 
 
 
193 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 
192 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  35.03 
 
 
193 aa  99.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  34.05 
 
 
201 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
179 aa  94  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
178 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0750  transcriptional regulator, XRE family  32.4 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  32.43 
 
 
199 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 
199 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  30.56 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  29.38 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  28.81 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  28.02 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  31.35 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1035  transcriptional regulator, XRE family  27.59 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 
201 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  29.67 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  31.22 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  31.32 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  29.51 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  30.68 
 
 
198 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  30.27 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 
180 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  27.78 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  30.06 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  32.61 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  27.23 
 
 
181 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  32.22 
 
 
181 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  26.74 
 
 
187 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  32.22 
 
 
181 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  33.13 
 
 
181 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 
188 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 
181 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 
188 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  31.67 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  26.32 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  31.67 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  29.48 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  33.13 
 
 
181 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  31.11 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  26.84 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3096  transcriptional regulator, XRE family  27.09 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00124629  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  32.77 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  27.6 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  27.22 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  26.67 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2356  transcriptional regulator, XRE family  29.57 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.190302 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  27.47 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0168  XRE family transcriptional regulator  29.12 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  28.08 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.207069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>