64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0812 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0812  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 91 aa  186  8e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000379382  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0025  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.56 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2511  putative oxidase  39.71 
 
 		 183 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.71 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2725  Acireductone dioxygenase ARD  46 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1549  Acireductone dioxygenase ARD  46 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0873  cupin 2 domain-containing protein  32.86 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2021  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like  42 
 
 		 186 aa  47  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1265  Acireductone dioxygenase ARD  38.6 
 
 		 179 aa  47  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  39.34 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.62 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1414  Acireductone dioxygenase ARD  50 
 
 		 179 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  38.18 
 
 		 311 aa  46.2  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0651  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2' -like  45.65 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.573573  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2624  Acireductone dioxygenase ARD  44 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3175  acireductone dioxygenase ARD  47.83 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178399  hitchhiker  0.00313013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.59 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1141  acireductone dioxygenase, ARD  42 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0908  acireductone dioxygenase, ARD  37.7 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23790  Acireductone dioxygenase, ARD  36.07 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  40.74 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1190  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.36 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4683  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  9.43245e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.17 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2596  Acireductone dioxygenase ARD  31.88 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00332409  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0018  acireductone dioxygenase, ARD  42 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3180  ARD/ARD' family dioxygenase  45.65 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2716  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21601  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like protein  43.48 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7093  hypothetical protein  29.21 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3455  Acireductone dioxygenase ARD  43.48 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3319  acireductone dioxygenase ARD  45.65 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3329  ARD/ARD' family dioxygenase  45.65 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.780596 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3301  Acireductone dioxygenase ARD  43.48 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2652  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  30 
 
 		 236 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0199  hypothetical protein  36.49 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0920  Acireductone dioxygenase ARD  39.13 
 
 		 180 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  34.92 
 
 		 135 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0887  Acireductone dioxygenase ARD  39.13 
 
 		 180 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42730  putative oxidase  38.46 
 
 		 181 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0094  Acireductone dioxygenase ARD  48.94 
 
 		 181 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00113178  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1781  Acireductone dioxygenase ARD  42 
 
 		 185 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.242318 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1138  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.6 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3588  putative oxidase  38.46 
 
 		 181 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1513  Acireductone dioxygenase ARD  47.83 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.354648  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0798  ARD/ARD' family dioxygenase  43.48 
 
 		 186 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.665186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0944  acireductone dioxygenase ARD  39.13 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3543  cupin 2 domain-containing protein  31.15 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76307  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1263  cupin 2 domain-containing protein  34.92 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.81 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1853  acireductone dioxygenase ARD  40.82 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0739842  normal  0.0828134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  35.29 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3776  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.42 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  31.75 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2288  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  42.31 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1725  acireductone dioxygenase, ARD  34.43 
 
 		 201 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0347  Mannose-1-phosphate guanylyltransferase  33.33 
 
 		 476 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4578  cupin 2 domain-containing protein  37.78 
 
 		 133 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2046  ARD/ARD' family protein  32.79 
 
 		 181 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00213486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>