13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4110 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4110  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 87 aa  176  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222501  normal  0.273262 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4222  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 87 aa  176  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7093  hypothetical protein  60.23 
 
 		 89 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4882  hypothetical protein  57.95 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.916909  normal  0.993747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0210  hypothetical protein  55.68 
 
 		 121 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1540  hypothetical protein  47.73 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0502839 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1346  hypothetical protein  46.59 
 
 		 89 aa  84  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0864  hypothetical protein  43.75 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0387292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1281  hypothetical protein  43.53 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240636 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0531  hypothetical protein  47.44 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0873  cupin 2 domain-containing protein  40.62 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0025  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.82 
 
 		 121 aa  40.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>