115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1863 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 100 aa  205  2e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  79.8 
 
 		 102 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  74.75 
 
 		 109 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  46.88 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  44.33 
 
 		 169 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  44.33 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  43.3 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  44.33 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  40.43 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.19 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  40.43 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2655  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  42.86 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104374  hitchhiker  0.00638268 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.98 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  31.25 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.46 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4192  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.09 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2840  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.862394  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  34.74 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.46 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0483  cupin 2 domain-containing protein  35.82 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  32.99 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  42.31 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  32.63 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  27.37 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6850  cupin 2 domain-containing protein  38.64 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.41 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  28.87 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1482  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.36 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.63 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  30.93 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2189  cupin 2 domain-containing protein  27.84 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.525757  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  29.17 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  36.84 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.63 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.53 
 
 		 113 aa  52  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  30.53 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1190  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.72 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0506  hypothetical protein  30.84 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0871689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3290  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.44 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.219448 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3954  cupin 2 domain-containing protein  38.2 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.266948 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.79 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.62 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.23 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3856  cupin 2, barrel  29.9 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.875667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1710  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.25 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  34.25 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  34.25 
 
 		 100 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3105  cupin 2 domain-containing protein  35.48 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.99 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0891  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0541662  normal  0.561597 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  32.58 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6741  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  46 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3485  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 271 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.881194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3608  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 271 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0804414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3410  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 272 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.623928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  42.37 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4742  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000930389 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0833  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.76 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  31.4 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1457  hypothetical protein  29.79 
 
 		 106 aa  43.9  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1794  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  35 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.14 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.14 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  35.8 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4076  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.82 
 
 		 231 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.38 
 
 		 128 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2229  cupin domain-containing protein  30.88 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0038  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 288 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.175935 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0006  hypothetical protein  30.88 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5823  hypothetical protein  36.76 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410893  normal  0.322015 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1696  cupin domain-containing protein  26.53 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2641  pectin degradation protein  26.53 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.229328 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1805  cupin 2 domain-containing protein  26.53 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  28.74 
 
 		 120 aa  42  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.18 
 
 		 220 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  26.09 
 
 		 272 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2080  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  25 
 
 		 268 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  35.09 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0947  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.75 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2209  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000991087  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  45.83 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1417  AraC family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 261 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17982  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0365  AraC family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 261 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0791032  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>