39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0564 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0564  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  217  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  87.74 
 
 		 106 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.17 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.588155  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.91 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1317  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.07 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00420  cupin domain-containing protein  27.18 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.91 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2588  cupin region  35.11 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  36.59 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2287  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.97 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.709012  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2150  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.07 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  23.08 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  31.11 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  32.56 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0413  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  29.63 
 
 		 480 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  21.88 
 
 		 115 aa  42  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2960  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  27.5 
 
 		 490 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.93 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2573  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  27.5 
 
 		 490 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  30.21 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0570  methionine--tRNA ligase  25.4 
 
 		 659 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.755013 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2263  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  27.84 
 
 		 473 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000496774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2348  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.72 
 
 		 471 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2209  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  25.71 
 
 		 479 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00321721  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2303  hypothetical protein  28.26 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000111298  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0766  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  25.86 
 
 		 472 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0623  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.72 
 
 		 481 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2312  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  25.71 
 
 		 479 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0322089 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2423  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  25.71 
 
 		 479 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.000878744 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.23 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2310  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  25.71 
 
 		 479 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0268586 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2968  cupin 2 domain-containing protein  33.71 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.71 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3243  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.43 
 
 		 475 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3281  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  27.78 
 
 		 476 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 130 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2994  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.43 
 
 		 475 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.81 
 
 		 133 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>