32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0445 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0445  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 123 aa  252  9e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.205887 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.21 
 
 		 136 aa  120  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.4 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.75 
 
 		 111 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  46.85 
 
 		 111 aa  103  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2044  hypothetical protein  34.48 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.11 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2831  cupin 2 domain-containing protein  29.73 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  44.64 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5098  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.67 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  34.09 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.1 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 		 286 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.19 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  30.85 
 
 		 152 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5845  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5448  cupin 2, barrel  27.27 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.708388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2150  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.71 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0118  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.07 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0464  mannose-6-phosphate isomerase type II  29.13 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  27.27 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>