81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7501 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 345 aa  716    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  59.13 
 
 		 349 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  55.43 
 
 		 348 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  55.43 
 
 		 348 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  56.18 
 
 		 348 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  55.56 
 
 		 364 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  55.43 
 
 		 370 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  55.29 
 
 		 348 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  57.06 
 
 		 348 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  53.85 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  53.85 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  54.93 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  53.55 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  53.25 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  52.99 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  52.99 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  52.99 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  54.44 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  54.81 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  53.49 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  53.94 
 
 		 353 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  52.99 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  52.99 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  52.4 
 
 		 342 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  52.4 
 
 		 342 aa  378  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  52.38 
 
 		 348 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  48.36 
 
 		 353 aa  358  6e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  46.13 
 
 		 344 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.98 
 
 		 350 aa  293  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.37 
 
 		 364 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  42.23 
 
 		 379 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.99 
 
 		 370 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  41.06 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  41.3 
 
 		 376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  37.01 
 
 		 370 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  39 
 
 		 373 aa  242  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0655  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.88 
 
 		 377 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.67 
 
 		 374 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  38.89 
 
 		 368 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  36.63 
 
 		 379 aa  226  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  36.96 
 
 		 372 aa  209  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  35.61 
 
 		 370 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  35.53 
 
 		 357 aa  202  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  37.33 
 
 		 377 aa  202  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  34.37 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  33.64 
 
 		 351 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  35.14 
 
 		 356 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  35.14 
 
 		 361 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  34.22 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  34.29 
 
 		 367 aa  194  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  34.86 
 
 		 361 aa  192  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0280  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.1 
 
 		 363 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  35.4 
 
 		 361 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  33.84 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  35.4 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  33.62 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  35.06 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  34.67 
 
 		 365 aa  186  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0738  cupin 2 domain-containing protein  31.78 
 
 		 349 aa  183  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  32.15 
 
 		 343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  32.84 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  36.01 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  31.63 
 
 		 324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 255 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0679  cupin 2 domain-containing protein  30.39 
 
 		 134 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  32.08 
 
 		 178 aa  52.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4263  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  36.05 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0334  hypothetical protein  28.21 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66391  normal  0.0124994 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3086  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  25.64 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.407832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  27.45 
 
 		 181 aa  46.6  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1883  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.85 
 
 		 157 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1204  hypothetical protein  30.38 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.919148  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2861  hypothetical protein  32.53 
 
 		 159 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2347  hypothetical protein  25.36 
 
 		 358 aa  43.5  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1750  cupin 2 domain-containing protein  28.4 
 
 		 162 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1734  cupin 2 domain-containing protein  28.4 
 
 		 162 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1684  cupin 2 domain-containing protein  28.4 
 
 		 162 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1706  cupin 2, barrel  28.05 
 
 		 148 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129353  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 121 aa  42.7  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  39.62 
 
 		 123 aa  42.7  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.82 
 
 		 111 aa  42.7  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>