97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1904 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1904  cupin region  100 
 
 		 120 aa  243  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  59.65 
 
 		 137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  60.83 
 
 		 121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.34 
 
 		 138 aa  147  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.32 
 
 		 118 aa  146  9e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  55.93 
 
 		 119 aa  141  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  56.78 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.22 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  38.61 
 
 		 177 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.62 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  33.65 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  38.75 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  28.3 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  33.65 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.01 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  31.46 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  38.16 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2662  cupin 2 domain-containing protein  32.47 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0577  hypothetical protein  35.44 
 
 		 125 aa  50.4  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116523  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01320  hypothetical protein  33.72 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333196  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1757  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.2 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  38.03 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00702  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  30.85 
 
 		 469 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1270  hypothetical protein  34.29 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.75 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.33 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4418  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.99 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  33.82 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  34.72 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  26.09 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3880  cupin 2, barrel  36.36 
 
 		 163 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0545  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.51 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  30.99 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  34.29 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.67 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.53 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  32.53 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  37.04 
 
 		 171 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 201 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1723  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.39 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.410123  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  27.91 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  37.31 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  28.74 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  27.96 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.94 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.62 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  28.26 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  28.26 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.62 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  28.26 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  27.17 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  29.29 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  28.26 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  27.03 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  38.24 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.67 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.84 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  38.1 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471134  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  31.58 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  28.75 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  29.49 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1056  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  31.58 
 
 		 505 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1315  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  37.04 
 
 		 467 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 128 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5139  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31 
 
 		 126 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 184 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2173  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  30.67 
 
 		 471 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0774935  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0441  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.12 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3867  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  32.18 
 
 		 519 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5021  cupin region  43.14 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00533136  normal  0.0498556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  30.56 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.26 
 
 		 204 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.26 
 
 		 204 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0544  hypothetical protein, putative phage gene  29.17 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597495  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0046  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  31.58 
 
 		 494 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1775  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  33.72 
 
 		 484 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.972729  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  26.13 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18490  mannose-6-phosphate isomerase  29.11 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.151918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 		 172 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  28.21 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  36.76 
 
 		 161 aa  40  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2663  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  30.67 
 
 		 478 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0379621  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0016  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose- 6-phosphate isomerase  28.12 
 
 		 447 aa  40  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>