32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0545 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0545  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 131 aa  270  5.000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0441  Cupin 2 conserved barrel domain protein  68.7 
 
 		 132 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0851  mate efflux family protein  55.91 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0817404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.29 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0997  cupin 2 domain-containing protein  45.71 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138878 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  35.97 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  28.74 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0912  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.97 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  31.51 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.99 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0698  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.59 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.793931  normal  0.732081 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  32.89 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  32.76 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5434  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.07 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429783  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2209  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000991087  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0680  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.99 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00734165  normal  0.352119 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  32.76 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  32.76 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0544  hypothetical protein, putative phage gene  33.33 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597495  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  32.76 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  31.03 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  32.31 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  32.88 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  28.85 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0028  double-stranded beta-helix-like protein  28.41 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 197 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.88 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  30.99 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  28 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  30.43 
 
 		 116 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>