19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5139 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5139  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 126 aa  257  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5434  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.32 
 
 		 135 aa  88.6  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  42.19 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0851  mate efflux family protein  32.95 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0817404  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0698  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.793931  normal  0.732081 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0997  cupin 2 domain-containing protein  26.73 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138878 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  30.63 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.18 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  40.85 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0441  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.94 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  31 
 
 		 120 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0680  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.76 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00734165  normal  0.352119 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2709  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  25.61 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1227  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.18 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.718162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  38.46 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087666  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0895  cupin 2 domain-containing protein  27.78 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0912  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.87 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>