19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0851 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0851  mate efflux family protein  100 
 
 		 124 aa  256  6e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0817404  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0545  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.91 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0441  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.33 
 
 		 132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.08 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  38.1 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0997  cupin 2 domain-containing protein  39.81 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5139  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.95 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5434  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.38 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0680  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00734165  normal  0.352119 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0698  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.17 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.793931  normal  0.732081 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  30.68 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4704  putative DNA-binding protein  52.63 
 
 		 274 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000153171  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0347  Mannose-1-phosphate guanylyltransferase  35.38 
 
 		 476 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.03 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.95 
 
 		 119 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  35.62 
 
 		 121 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.31 
 
 		 377 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  27.19 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>