14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0680 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0680  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 106 aa  211  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00734165  normal  0.352119 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0698  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.89 
 
 		 106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.793931  normal  0.732081 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0912  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.45 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.74 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0599  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.05 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.05 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0851  mate efflux family protein  33.33 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0817404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  29.89 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.73 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0545  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.99 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3504  cyclic nucleotide-binding protein  30.09 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5139  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.76 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.51 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0441  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 132 aa  40  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>