18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0997 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0997  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
137 aa  280  4.0000000000000003e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138878 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.62 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0441  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.46 
 
 
132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  37.14 
 
 
151 aa  111  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0545  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.71 
 
 
131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0851  mate efflux family protein  39.81 
 
 
124 aa  84  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0817404  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5434  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.26 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429783  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5139  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.73 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168258  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.81 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.908983 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0698  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.44 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.793931  normal  0.732081 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  22.61 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  29.03 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 
125 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.04 
 
 
114 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.67 
 
 
332 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1117  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.96 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136519  normal  0.299442 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  24.55 
 
 
172 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  32.73 
 
 
332 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>