48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1589 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
132 aa  267  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.908983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.18 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0177  cupin domain-containing protein  41.56 
 
 
175 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1309  cupin domain-containing protein  42.86 
 
 
175 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3623  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1236  cupin domain-containing protein  42.86 
 
 
175 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4101  cupin 2 domain-containing protein  41.56 
 
 
175 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7061  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.26 
 
 
175 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.985846 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2496  hypothetical protein  42.86 
 
 
175 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4566  cupin 2 domain-containing protein  41.56 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464338  hitchhiker  0.000237614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4235  cupin 2 domain-containing protein  41.56 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1107  hypothetical protein  41.56 
 
 
175 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.049501  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0974  hypothetical protein  42.86 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1334  hypothetical protein  42.86 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0317  hypothetical protein  42.86 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453914  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0593  hypothetical protein  42.86 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133951  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3986  cupin 2 domain-containing protein  41.56 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0531133  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5593  cupin 2 domain-containing protein  41.56 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0614455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4707  cupin 2 domain-containing protein  41.56 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324848  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3660  cupin 2, barrel  41.56 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276566  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1499  hypothetical protein  41.56 
 
 
175 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4640  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.77 
 
 
178 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650295  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4508  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.77 
 
 
178 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0997  cupin 2 domain-containing protein  28.81 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138878 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0698  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.7 
 
 
106 aa  45.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.793931  normal  0.732081 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2810  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.88 
 
 
191 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.597474  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3572  cupin region  33.77 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0140245  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3691  cupin 2, barrel  33.77 
 
 
178 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.224723  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0949  cupin 2 domain-containing protein  33.77 
 
 
176 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  32.85 
 
 
190 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 
118 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0138  cupin 2 protein  33.77 
 
 
174 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.31 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3961  cupin 2 domain-containing protein  33.77 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  28.21 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.86 
 
 
138 aa  42  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3171  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.17 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.480255  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  37.18 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1117  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.42 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136519  normal  0.299442 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 
152 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  28.28 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.87 
 
 
172 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.52 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  27.18 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2020  cupin 2, barrel  28.85 
 
 
155 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434776 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  34.41 
 
 
159 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  31.51 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3472  hypothetical protein  33.93 
 
 
276 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.489268  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>