47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1499 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1499  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  361  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1236  cupin domain-containing protein  98.86 
 
 
175 aa  359  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1309  cupin domain-containing protein  98.86 
 
 
175 aa  359  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3623  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2496  hypothetical protein  98.86 
 
 
175 aa  359  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0317  hypothetical protein  98.29 
 
 
177 aa  358  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453914  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0593  hypothetical protein  98.29 
 
 
175 aa  357  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133951  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1334  hypothetical protein  98.29 
 
 
175 aa  357  3e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0974  hypothetical protein  98.29 
 
 
175 aa  357  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3986  cupin 2 domain-containing protein  92.57 
 
 
175 aa  344  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0531133  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4235  cupin 2 domain-containing protein  93.71 
 
 
179 aa  343  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7061  Cupin 2 conserved barrel domain protein  92.57 
 
 
175 aa  343  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.985846 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0177  cupin domain-containing protein  92 
 
 
175 aa  343  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5593  cupin 2 domain-containing protein  92 
 
 
175 aa  342  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0614455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3660  cupin 2, barrel  92 
 
 
175 aa  342  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4707  cupin 2 domain-containing protein  92 
 
 
175 aa  342  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324848  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1107  hypothetical protein  90.86 
 
 
175 aa  341  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.049501  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4566  cupin 2 domain-containing protein  90.29 
 
 
175 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464338  hitchhiker  0.000237614 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4101  cupin 2 domain-containing protein  90.29 
 
 
175 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4508  Cupin 2 conserved barrel domain protein  75 
 
 
178 aa  283  7e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4640  Cupin 2 conserved barrel domain protein  75 
 
 
178 aa  283  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650295  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3691  cupin 2, barrel  71.35 
 
 
178 aa  281  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.224723  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3572  cupin region  73.84 
 
 
178 aa  279  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0140245  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0949  cupin 2 domain-containing protein  72.46 
 
 
176 aa  278  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3171  Cupin 2 conserved barrel domain protein  75.46 
 
 
182 aa  275  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.480255  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0138  cupin 2 protein  62.65 
 
 
174 aa  232  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3961  cupin 2 domain-containing protein  59.88 
 
 
174 aa  231  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0819  cupin 2, barrel  65.64 
 
 
189 aa  227  7e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.105884  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.07 
 
 
172 aa  140  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3109  cupin region  39.22 
 
 
175 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2810  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.67 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.597474  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1620  cupin 2 domain-containing protein  34.78 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.56 
 
 
132 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.908983 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1112  cupin 2 protein  33.93 
 
 
340 aa  47  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.792724  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 
141 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3115  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.64 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768633  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  26.92 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.64 
 
 
157 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4294  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 
323 aa  45.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.689611 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4085  cupin 2 protein  31.25 
 
 
324 aa  45.1  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2945  cupin 2 protein  30.71 
 
 
177 aa  45.1  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0664771  decreased coverage  0.00000748463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.23 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.87 
 
 
131 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  32.14 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3473  cupin 2 domain-containing protein  38.81 
 
 
162 aa  42  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.017049  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.21 
 
 
170 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0792  hypothetical protein  35.44 
 
 
170 aa  41.2  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817049  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3173  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.44 
 
 
171 aa  41.2  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457718 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>