52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2810 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2810  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
191 aa  387  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.597474  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2945  cupin 2 protein  38.67 
 
 
177 aa  88.2  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0664771  decreased coverage  0.00000748463 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1620  cupin 2 domain-containing protein  36.94 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02552  hypothetical protein  45.35 
 
 
334 aa  74.7  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1112  cupin 2 protein  37.04 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.792724  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4085  cupin 2 protein  38.89 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4294  cupin 2 domain-containing protein  38.24 
 
 
323 aa  68.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.689611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0949  cupin 2 domain-containing protein  30.67 
 
 
176 aa  59.7  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3572  cupin region  30.67 
 
 
178 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0140245  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4235  cupin 2 domain-containing protein  32.67 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0819  cupin 2, barrel  31.54 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.105884  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1236  cupin domain-containing protein  34 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4640  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650295  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4508  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1309  cupin domain-containing protein  34 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3623  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0317  hypothetical protein  34 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453914  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3691  cupin 2, barrel  33.1 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.224723  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2496  hypothetical protein  34 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0974  hypothetical protein  34 
 
 
175 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3139  cupin domain protein  30.48 
 
 
376 aa  56.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557804  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0593  hypothetical protein  34 
 
 
175 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133951  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1334  hypothetical protein  34 
 
 
175 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7061  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
175 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.985846 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3171  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.67 
 
 
182 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.480255  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0138  cupin 2 protein  32.86 
 
 
174 aa  55.1  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1499  hypothetical protein  32.67 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0177  cupin domain-containing protein  36.71 
 
 
175 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1107  hypothetical protein  36.71 
 
 
175 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.049501  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4101  cupin 2 domain-containing protein  35.9 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4566  cupin 2 domain-containing protein  35.9 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464338  hitchhiker  0.000237614 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3986  cupin 2 domain-containing protein  32.64 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0531133  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3660  cupin 2, barrel  35.9 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276566  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5593  cupin 2 domain-containing protein  35.9 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0614455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4707  cupin 2 domain-containing protein  35.9 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324848  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.45 
 
 
117 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3109  cupin region  36.08 
 
 
175 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.88 
 
 
132 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.908983 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.62 
 
 
136 aa  46.2  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 
165 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.86 
 
 
160 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.62 
 
 
369 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 
165 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  32.88 
 
 
165 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2403  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5 epimerase  35.29 
 
 
158 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.930193  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.44 
 
 
126 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.71 
 
 
192 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 
165 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
178 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  32.5 
 
 
166 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3961  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 
174 aa  42.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 
158 aa  42  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5036  cupin 2 domain-containing protein  29.13 
 
 
340 aa  41.6  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484902  normal  0.704388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>