11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3139 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3139  cupin domain protein  100 
 
 		 376 aa  776    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02552  hypothetical protein  46 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1112  cupin 2 protein  35.85 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.792724  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4294  cupin 2 domain-containing protein  39.77 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.689611 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4085  cupin 2 protein  35.08 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5036  cupin 2 domain-containing protein  32.84 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484902  normal  0.704388 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2945  cupin 2 protein  28.57 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0664771  decreased coverage  0.00000748463 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1620  cupin 2 domain-containing protein  28.81 
 
 		 176 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2810  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.48 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.597474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0947  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.72 
 
 		 154 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0829  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.84 
 
 		 153 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55618  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>