41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1620 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1620  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 176 aa  357  5e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2945  cupin 2 protein  39.41 
 
 		 177 aa  138  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0664771  decreased coverage  0.00000748463 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4294  cupin 2 domain-containing protein  37.28 
 
 		 323 aa  107  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.689611 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4085  cupin 2 protein  39.02 
 
 		 324 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1112  cupin 2 protein  36.81 
 
 		 340 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.792724  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02552  hypothetical protein  34.97 
 
 		 334 aa  94.7  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2810  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.94 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.597474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3139  cupin domain protein  28.81 
 
 		 376 aa  79  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5036  cupin 2 domain-containing protein  30.67 
 
 		 340 aa  75.5  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484902  normal  0.704388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3109  cupin region  34.04 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0138  cupin 2 protein  37.07 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3961  cupin 2 domain-containing protein  33.93 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0819  cupin 2, barrel  36.21 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.105884  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0593  hypothetical protein  33.8 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133951  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0974  hypothetical protein  33.8 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1236  cupin domain-containing protein  33.8 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1309  cupin domain-containing protein  33.8 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3623  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1334  hypothetical protein  33.8 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2496  hypothetical protein  33.8 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0317  hypothetical protein  33.8 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453914  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7061  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.985846 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4235  cupin 2 domain-containing protein  33.1 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0177  cupin domain-containing protein  34.78 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1107  hypothetical protein  34.78 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.049501  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1499  hypothetical protein  34.78 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3572  cupin region  30.28 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0140245  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3691  cupin 2, barrel  34.78 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.224723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0949  cupin 2 domain-containing protein  31.69 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3171  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.91 
 
 		 182 aa  51.6  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.480255  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4508  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.17 
 
 		 178 aa  51.2  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4640  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.17 
 
 		 178 aa  51.2  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650295  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4101  cupin 2 domain-containing protein  33.91 
 
 		 175 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4566  cupin 2 domain-containing protein  33.91 
 
 		 175 aa  50.8  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464338  hitchhiker  0.000237614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3660  cupin 2, barrel  33.91 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4707  cupin 2 domain-containing protein  33.91 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324848  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3986  cupin 2 domain-containing protein  33.91 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0531133  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5593  cupin 2 domain-containing protein  33.91 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0614455 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 108 aa  42  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5448  cupin 2, barrel  30.91 
 
 		 147 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.708388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5845  cupin 2 domain-containing protein  30.91 
 
 		 147 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2326  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  40.8  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>